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Structure-Based Discovery of Mycobacterium tuberculosis VapC30-Activating Stapled Peptides
:Mycobacterium tuberculosis 유래 VapC30 구조기반 항생제 펩타이드에 관한 연구

DC Field Value Language
dc.contributor.advisor이봉진-
dc.contributor.author한상우-
dc.date.accessioned2021-11-30T04:32:18Z-
dc.date.available2021-11-30T04:32:18Z-
dc.date.issued2021-02-
dc.identifier.other000000163792-
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/10371/175781-
dc.identifier.urihttps://dcollection.snu.ac.kr/common/orgView/000000163792ko_KR
dc.description학위논문 (석사) -- 서울대학교 대학원 : 약학대학 약학과, 2021. 2. 이봉진.-
dc.description.abstractToxin-antitoxin (TA) systems have been considered essential factors for
bacterial survival. During our drug development program aimed against
tuberculosis (TB), we discovered certain peptides that mimic the binding of
the VapBC30 complex, leading to the arrest of bacterial cell growth and
eventually cell death. Herein, we optimized these candidate peptides based
on a hydrocarbon stapling strategy and performed biological in vitro
evaluations. The V30-SP-8 peptide successfully penetrated Mycobacterium
smegmatis cell membranes and exerted bactericidal activity at a minimum
inhibitory concentration that inhibited 50% of the isolates (MIC50) between
12.5 M and 25.0 M. With the aid of structural and biochemical
information for the VapBC30 TA system from M. tuberculosis, we suggest
potential antimicrobial agents that could provide a platform to establish a
novel antibacterial strategy. Reflecting the limited number of therapeutic
agents targeting TA systems, we believe that this study not only provides
chemical tools for exploring the biological events relevant to TA systems but
also opens a new gateway toward TB drug discovery.
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dc.description.abstract독소-항독소 시스템은 박테리아의 생존에 필수적인 요소로 알려
져 있습니다. 저희가 결핵균을 타겟으로 하는 신약 개발 과정을
수행하는 동안, 저희 연구실은 VapBC30 복합체의 결합을 모방한
특정 펩타이드들이 박테리아의 성장을 억제하고 결국에는 사멸하
게 만든다는 사실을 발견하였습니다. 여기서 저희는 이 후보물질
들을 최적화하기 위하여 stapling 기술을 적용한 후, 생물학적 평
가를 진행하였습니다. 평가 결과, 여러 후보 물질들 중 V30-SP-
8 펩타이드가 Mycobacterium smegmatis의 세포벽을 성공적으로
투과하고, 12.5M과 25.0M 사이의 농도에서 MIC50를 가진다는
것을 확인하였습니다. M. tuberculosis에서 유래한 VapBC30 TA
system의 구조 정보와 생화학적인 정보를 바탕으로 잠재적인 새
로운 항생물질을 제시하고, 새로운 신약개발의 전략을 제시했습니
다. 또한, TA 시스템 기반의 약물은 거의 전무하다는 것을 감안하
면, 이것은 단순히 TA 시스템과 연관된 물질을 탐구한 것이 아니
라 항결핵제의 새로운 발견을 시작을 시사하는 연구입니다.
-
dc.description.tableofcontentsChapter 1. Introduction ........................................................... 1

Chapter 2. Result and Discussion ........................................... 3

2.1 Alanine Scanning of Linear Peptides and Design of Stapled
Peptides ........................................................................................... 3
2.2 In Vitro RNase Assay Against Stapled Peptides .................... 4
2.3 CD Spectrometry of Linear Peptides and Stapled Peptides ... 6
2.4 Evaluation of Cell Permeability ................................................ 7
2.5 Antibacterial Activity of V30-SP-8 and V30-SP-9 ............ 8

Chapter 3. Conclusion ........................................................... 11

Chapter 4. Experimental methods ........................................ 12

Chapter 5. Supporting Information ........................................ 16

References ............................................................................ 24

Abstract in Korean ................................................................ 27
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dc.format.extentii, 27-
dc.language.isoeng-
dc.publisher서울대학교 대학원-
dc.subjectToxin-antitoxin-
dc.subjecttuberculosis-
dc.subjectpeptides-
dc.subjectantimicrobial agents-
dc.subjectnovel antibacterial strategy-
dc.subject독소-항독소-
dc.subject결핵-
dc.subject펩타이드-
dc.subject항생물질-
dc.subject신약 개발-
dc.subject.ddc615-
dc.titleStructure-Based Discovery of Mycobacterium tuberculosis VapC30-Activating Stapled Peptides-
dc.title.alternative:Mycobacterium tuberculosis 유래 VapC30 구조기반 항생제 펩타이드에 관한 연구-
dc.typeThesis-
dc.typeDissertation-
dc.contributor.AlternativeAuthorHAN Sangwoo-
dc.contributor.department약학대학 약학과-
dc.description.degreeMaster-
dc.date.awarded2021-02-
dc.contributor.major물리약학-
dc.identifier.uciI804:11032-000000163792-
dc.identifier.holdings000000000044▲000000000050▲000000163792▲-
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College of Pharmacy (약학대학)Dept. of Pharmacy (약학과)Theses (Master's Degree_약학과)
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