소아기에 조기 발병한 한국인 크론병 환자에서 autophagy 관련 유전자의 다형성에 관한 연구

Abstract

목적: 소아기에 조기 발병한 한국인 크론병 환자에서 autophagy pathway와 관련된 ATG16L1, IRGM, ULK1, NOD2 유전자의 다형성에 대해 알아보고자 하였다. 대상 및 방법: 2000년 1월부터 2012년 5월까지 서울대학교 어린이병원에서 크론병으로 진단 받은 환자 중에서 발병시 연령이 15세 이하인 환자 65명을 환자군으로, 건강한 72명을 대조군으로 하였다. 11개의 SNP[ATG16L1 SNP rs2241880, IRGM SNP (rs13361189, rs4958847, rs1000113, rs10065172, rs72553867), ULK1 SNP (rs12303764, rs10902469, rs7488085), NOD2 SNP (Arg702Trp, Gly908Arg)]에 대해 Taqman assay로 분석하였고, NOD2 SNP leu1007fsinsC은 직접 시퀀싱법으로 분석하였다. 환자군의 발병시 연령은 8.6±4.72세였고, 1세 이하는 12명(18.5%)이었으며 1세 이하와 8세 이상에 주로 분포하였다. 결과: 12개의 SNP중에서 2개의 SNP이 유의한 결과를 보였다. IRGM SNP rs1000113은 대립유전자 빈도(OR 1.71 95% CI: 1.05-2.79, p=0.03)와 유전형 분포(dominant model

OR 2.17 95% CI 1.07-4.39, p=0.03)에서 크론병과의 연관성을 보였다. IRGM SNP rs72553867은 대립유전자 빈도(OR 0.50 95% CI: 0.27-0.91, p=0.02)와 유전형 분포(dominant model

OR= 0.50

95% CI, 0.23-0.94, p=0.03)에서 크론병과의 연관성을 보였다. ATG16L1, ULK1은 크론병과 연관성이 없었다. NOD2의 SNP(Arg702Trp, Gly908Arg, leu1007fsinsC)은 환자군과 대조군 모두에서 wild-type으로만 관찰되었다. 유전형-표현형 분석에서 발병 연령, 병변의 위치, 병변의 행태와의 연관성은 없었다. 결론: 본 연구에서 IRGM SNP rs1000113은 위험인자로, IRGM SNP rs72553867은 방어인자로 조기 발병한 크론병과의 연관성을 보였다. 이는 소아기에 조기 발병한 크론병에서 autophagy pathway가 중요한 역할을 하고 있음을 시사한다.